Anomalisa được viết năm 2005 cho vở kịch của Los Angeles mang tên "Theater of the New Ear", được miêu tả là 'một buổi hòa nhạc với âm nhạc và lời thoại hoặc bối cảnh của "những vở kịch âm thanh"' của Carter Burwell, người ủy quyền và soạn nhạc chúng.[10] Nó là một tờ quảng cáo đôi với Hope Leaves the Theater của Kaufman và thay thế Sawbones của anh em nhà Coen, từ vở kịch trước đó của New York sau khi những diễn viên của vở kịch không thể góp mặt.[11] Anomalisa được ghi dưới bút danh Francis Fregoli, một sự liên hệ đến ảo tưởng Fregoli, một niềm tin rằng trong thực tế những người khác nhau chỉ là một người duy nhất thay đổi diện mạo hoặc trong lớp ngụy trang.[12] Màn biểu diễn năm 2005 có Thewlis và Leigh ngồi phía đối diện sân khấu với Noonan ngồi giữa; Burwell đã chỉ huy Đoàn múa hình parabol, bao gồm cả một nghệ nhân âm thanh.[10][13]

Những con rối được tạo ra với việc sử dụng in 3D[14] cùng nhiều bản sao của mỗi nhân vật: 18 Michael và sáu Lisa được tạo ra.[15] Trong khi Johnson được nói rằng hình ảnh động thực như vậy "sẽ làm rối trí và gây khó chịu" thì ông lại không đồng tình.[16] Nói về cảnh nóng trong phim, đạo diễn Charlie Kaufman chia sẻ: "Chúng tôi muốn cảnh này chân thực về mặt cảm xúc như mọi cảnh khác của phim. Chúng tôi hiểu các nhân vật con rối trong phim làm tình sẽ dễ trở thành trò cười trong mắt khán giả. Đây là cảnh khó nhất phim và cũng là cảnh khó nhất mà giới làm hoạt hình từng thực hiện".[17] Quá trình thực hiện riêng cảnh thân mật giữa hai nhân vật chính dài tới sáu tháng.[17] Êkíp sáng tạo gặp khó nhất khi hiện thực hóa chi tiết con rối cởi bỏ áo quần bởi cơ thể chúng không thể cúi cong như người. Đạo diễn Johnson kể: "Chúng tôi phải chặt hai con rối thành các mảnh vụn nhỏ, sau đó bóc từng mẩu vải dính vào mỗi mảnh cơ thể rối. Tiếp đến, chúng tôi lại ráp nối các mảnh vỡ của con rối thành một cơ thể nude".[17] Công nghệ tiên tiến được áp dụng để chân thực hóa đúp cảnh hai con rối xoắn quyện vào nhau khi thân mật. Chuyển động của mọi vật xung quanh hai nhân vật chính cũng được xử lý kỹ lưỡng.[17]